これまで問題なく使えていたのですが、最近になって機能しなくなっていることに気づきました。検索してみたところちょうどこの現象のようで、システム環境設定のキーボード設定の「入力ソース」で英語が設定されていたのを一度削除したら解消しました。(どうもやら一旦削除すれば直るらしく、その後ふたたび他の入力ソースを追加しても大丈夫でした。)
が、この変更の後でEmacsでCtrl+スペースが使えなくなってることに気づきました。変更の副作用でシステム環境設定のキーボード設定の「ショートカット」にて、入力ソースの「前の入力ソースを選択」が有効になってしまったようです。このチェックを外せば大丈夫です。